La stazione Museo rappresenta un importante nodo del sistema Metronapoli, sia per la posizione e gli intensi flussi turistici, sia per la presenza del nodo di interscambio con la stazione Cavour (linea2), e quindi con i treni della Metropolitana Regionale. Su progetto di Gae Aulenti, di questa stazione sono interessanti soprattutto gli interventi di riqualificazione urbana all'esterno, e le infrastrutture di collegamento. L'intera piazza Cavour esce rivoluzionata dall'opera: all'articolato edificio di ingresso alla stazione, di color rosso a richiamare i colori e la struttura dell'antistante Museo Nazionale, si aggiungono giardini, aiuole, chioschi e fontane nel tratto tra le stazioni Museo e Cavour. All'interno della stazione si erge imponente la riproduzione dell'Ercole Farnese, eseguito dagli allievi dell'Accademia delle Belle Arti. E ancora l'originale della Testa Carafa, messa a disposizione dal Museo Nazionale. Completano infine il percorso, integrandosi coerentemente con le opere precedenti, le immagini evocative di Mimmo Iodice.